樽海鞘對人類無害，一般生活在寒冷的海域產生大量的熱量，有一些專家研究后產生懷疑，全球變暖有一部分原因也許就是成群的樽海鞘造成的。據科學家統計計算，樽海鞘大約消耗由浮游植物產生的碳總量的74%，同時利用自己的“排泄小球”向深海轉運大約四千噸碳。
它們將零散的碳聚集到一起，使之沉降的更快。在以前的研究中樽海鞘的排泄小球一天大約下降一千米。即使是死亡了，它們每天也能以475米的高速沉降。如果樽海鞘真的處在食物鏈的末端并在沉降的過程中不被吃掉的話，他們能給海洋中運輸進更多的碳。
樽海鞘白天向下游很遠，而夜里又向上游回去，這一過程被稱作垂直運動。像這樣，樽海鞘向深海中釋放排泄小體，令很少有動物能在那吃掉它們，這也大大增加碳從大氣中轉移出去的機會。它們在海洋食物鏈中的位置并不重要，但是卻是為海洋提供溫室氣體的重要成員，這一觀點大大提升了樽海鞘在海洋動物中的地位。
